Согласно приказу ректора университета под №110 от 5 декабря 2007 года о подготовке высококвалифицированных специалистов в области связи, электронной техники и информационных технологий с 1 сентября 2007 года в образовательной структуре университета на базе Института Создан факультет управления и компьютерных технологий, телекоммуникаций и информационных технологий. Инициатором и первым деканом вновь созданного факультета был до 2010 года был доктор экономических наук, профессор Кадыров А.Л.

20 августа 1991 года приказом Министерства образования Республики Таджикистан был создан экономический факультет. В апреле 1996 года экономический факультет был разделен на два факультета. Один из них – управление и экономика (декан А. Маджидов), другой – кибернетика, возглавляемый профессором Т. Джалиловым. В июне 1996 года деканом факультета был назначен Умаров З.Х.

В декабре 1999 года два факультета были объединены и преобразованы в экономический факультет, деканом которого стал доцент А. Абдуллаев. Деятельность экономического факультета продолжалась год. В ноябре 2000 года на базе этого факультета были созданы факультеты кибернетики (декан А. Абдуллоев) и Финансов и рыночной экономики (декан А. Маджидов).

До 2006 года факультет готовил специалистов в области бухгалтерского учета и аудита, автоматизированных систем обработки информации и управления, программного обеспечения ЭВМ, организации и технологии обеспечения информационной безопасности, международных экономических отношений.

С ноября 2003 г. по февраль 2009 г. декан факультета кибернетики, доцент Д.М. Осимова, с февраля 2009 г. по июль 2012 г., д.э.н., профессор Т.Р. Ризокулов, а с июля 2012 года доктор экономических наук, профессор А.М. Рахимов.

Согласно приказу ректора Худжандского государственного университета имени Б.Гафурова от 29 января 2015 года и на основании решения Ученого совета университета произошло слияние факультетов телекоммуникаций и информационных технологий и кибернетики. С июня 2015 года должность декана факультета занимает к.т.н., доцент Музафаров Д., а с марта 2016 г. к.т.н., доцент Нуриддинова М.И. С ноября 2016 года заведующей кафедрой является к.т.н., доцент Г. Узокова.

В структуре факультета 3 профильных кафедры:

• Кафедра информационных технологий по экономике, специализирующая на «Экономической кибернетике», «Автоматизация систем сбора, учета и обработки информации, финансов и бизнеса».

• Кафедра программирования отвечает за подготовку высококвалифицированных кадров по специальностям: «Программное обеспечение информационных технологий», «Компьютерная безопасность».

• Кафедра многосетевых телекоммуникационных систем отвечает за подготовку специалистов по специальности «Многосетевые телекоммуникационные системы».

В целях подготовки высококвалифицированных специалистов и удовлетворения требований труда факультет на высоком уровне сотрудничает с производственными, финансовыми и телекоммуникационными компаниями.

В учебном процессе используются 9 компьютерных лабораторий и 2 телекоммуникационных лабораторий.